MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4b

Total Repeats: 2501

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2003	NC_011991	TGC	2	6	104433	104438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109208
2004	NC_011991	TCG	2	6	104450	104455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109208
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2007	NC_011991	AAC	2	6	104894	104899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222109208
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2012	NC_011991	CCGA	2	8	105241	105248	25 %	0 %	25 %	50 %	222109208
2013	NC_011991	TGG	2	6	105263	105268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222109208
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2124	NC_011991	ATA	2	6	111270	111275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222109209
2125	NC_011991	CTA	2	6	111344	111349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109209
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2245	NC_011991	GAT	2	6	118024	118029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109212
2246	NC_011991	GCG	2	6	118231	118236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109213
2247	NC_011991	CT	3	6	118286	118291	0 %	50 %	0 %	50 %	222109213
2248	NC_011991	TTC	2	6	118364	118369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109213
2249	NC_011991	CCG	2	6	118385	118390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109213
2250	NC_011991	GCCA	2	8	118408	118415	25 %	0 %	25 %	50 %	222109213
2251	NC_011991	CCG	2	6	118418	118423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109213
2252	NC_011991	ATG	2	6	118451	118456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109213
2253	NC_011991	TGAC	2	8	118480	118487	25 %	25 %	25 %	25 %	222109213
2254	NC_011991	TGC	2	6	118676	118681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109213
2255	NC_011991	CTTGC	2	10	118741	118750	0 %	40 %	20 %	40 %	222109213
2256	NC_011991	GTT	2	6	118753	118758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222109213
2257	NC_011991	CGCA	2	8	118792	118799	25 %	0 %	25 %	50 %	222109213
2258	NC_011991	CCG	2	6	118818	118823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109213
2259	NC_011991	CCTGCC	2	12	118851	118862	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	222109213
2260	NC_011991	CGC	2	6	118948	118953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109213
2261	NC_011991	TGC	2	6	119051	119056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109213
2262	NC_011991	GTC	2	6	119057	119062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109213
2263	NC_011991	TCG	2	6	119195	119200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109213
2264	NC_011991	CCGA	2	8	119222	119229	25 %	0 %	25 %	50 %	222109213
2265	NC_011991	CAC	2	6	119244	119249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109213
2266	NC_011991	ACG	2	6	119288	119293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109213
2267	NC_011991	AGA	3	9	119322	119330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222109213
2268	NC_011991	TCA	2	6	119366	119371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109213
2269	NC_011991	TCC	2	6	119372	119377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222109213
2270	NC_011991	TCG	2	6	119476	119481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109214
2271	NC_011991	CG	3	6	119523	119528	0 %	0 %	50 %	50 %	222109214
2272	NC_011991	CGGTCG	2	12	119584	119595	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222109214
2273	NC_011991	CGG	2	6	119722	119727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109214
2274	NC_011991	CGG	2	6	119737	119742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109214
2275	NC_011991	GCC	2	6	119792	119797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109214
2276	NC_011991	CGT	2	6	119801	119806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109214
2277	NC_011991	CTG	2	6	119889	119894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109215
2278	NC_011991	CTG	3	9	119906	119914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109215
2279	NC_011991	CCGA	2	8	119915	119922	25 %	0 %	25 %	50 %	222109215
2280	NC_011991	CGAT	2	8	119943	119950	25 %	25 %	25 %	25 %	222109215
2281	NC_011991	ACC	2	6	119961	119966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109215
2282	NC_011991	TGT	3	9	119971	119979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222109215
2283	NC_011991	TCC	2	6	120008	120013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222109215
2284	NC_011991	GGTT	2	8	120101	120108	0 %	50 %	50 %	0 %	222109215
2285	NC_011991	GCGG	2	8	120113	120120	0 %	0 %	75 %	25 %	222109215
2286	NC_011991	ATG	2	6	120177	120182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109215
2287	NC_011991	TCT	2	6	120193	120198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109215
2288	NC_011991	CCG	2	6	120205	120210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109215
2289	NC_011991	GCT	2	6	120214	120219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109215
2290	NC_011991	CG	3	6	120250	120255	0 %	0 %	50 %	50 %	222109215
2291	NC_011991	TGATA	2	10	120286	120295	40 %	40 %	20 %	0 %	222109215
2292	NC_011991	CGT	2	6	120308	120313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109215
2293	NC_011991	GCG	2	6	120379	120384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109215
2294	NC_011991	GAC	2	6	120390	120395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109215
2295	NC_011991	CGA	2	6	120427	120432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109215
2296	NC_011991	GCTGCA	2	12	120457	120468	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222109215
2297	NC_011991	GAC	2	6	120494	120499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109215
2298	NC_011991	AGAT	2	8	120522	120529	50 %	25 %	25 %	0 %	222109215
2299	NC_011991	CTTG	2	8	120599	120606	0 %	50 %	25 %	25 %	222109215
2300	NC_011991	GCA	2	6	120618	120623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109215
2301	NC_011991	CGCA	2	8	120674	120681	25 %	0 %	25 %	50 %	222109215
2302	NC_011991	TC	3	6	120703	120708	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2303	NC_011991	GCG	2	6	120796	120801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109216
2304	NC_011991	GCCC	2	8	120851	120858	0 %	0 %	25 %	75 %	222109216
2305	NC_011991	CAGTC	2	10	120874	120883	20 %	20 %	20 %	40 %	222109216
2306	NC_011991	TGT	2	6	120916	120921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222109216
2307	NC_011991	GTT	2	6	120983	120988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222109216
2308	NC_011991	GATC	2	8	121073	121080	25 %	25 %	25 %	25 %	222109216
2309	NC_011991	ACG	2	6	121116	121121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109216
2310	NC_011991	TCG	2	6	121125	121130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109216
2311	NC_011991	CCCG	2	8	121154	121161	0 %	0 %	25 %	75 %	222109216
2312	NC_011991	CTGG	2	8	121214	121221	0 %	25 %	50 %	25 %	222109216
2313	NC_011991	GCC	2	6	121310	121315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109216
2314	NC_011991	CATTC	2	10	121324	121333	20 %	40 %	0 %	40 %	222109216
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2319	NC_011991	TGC	2	6	121509	121514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109217
2320	NC_011991	AGCCG	2	10	121527	121536	20 %	0 %	40 %	40 %	222109217
2321	NC_011991	CGG	2	6	121580	121585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109217
2322	NC_011991	GCT	2	6	121686	121691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109217
2323	NC_011991	ACG	2	6	121708	121713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109217
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2325	NC_011991	GAC	2	6	121755	121760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109217
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2327	NC_011991	GC	3	6	121848	121853	0 %	0 %	50 %	50 %	222109217
2328	NC_011991	ATC	2	6	121855	121860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109217
2329	NC_011991	CCG	2	6	121939	121944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109217
2330	NC_011991	ACAT	2	8	121978	121985	50 %	25 %	0 %	25 %	222109217
2331	NC_011991	CCA	2	6	121988	121993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109217
2332	NC_011991	CGAAA	2	10	121998	122007	60 %	0 %	20 %	20 %	222109217
2333	NC_011991	CGAG	2	8	122018	122025	25 %	0 %	50 %	25 %	222109217
2334	NC_011991	CAC	2	6	122034	122039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109217
2335	NC_011991	GAT	3	9	122052	122060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109217
2336	NC_011991	CCG	2	6	122167	122172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109217
2337	NC_011991	CGA	2	6	122198	122203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109217
2338	NC_011991	CTG	2	6	122226	122231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109217
2339	NC_011991	ATA	2	6	122260	122265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222109217
2340	NC_011991	CGG	2	6	122324	122329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109217
2341	NC_011991	GATC	2	8	122442	122449	25 %	25 %	25 %	25 %	222109217
2342	NC_011991	CGA	2	6	122486	122491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109217
2343	NC_011991	TGC	2	6	122520	122525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109217
2344	NC_011991	G	6	6	122556	122561	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2345	NC_011991	T	6	6	122565	122570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2346	NC_011991	GTC	2	6	122579	122584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2347	NC_011991	ATC	2	6	122590	122595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2348	NC_011991	TCA	2	6	122607	122612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2349	NC_011991	CGC	3	9	122644	122652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2350	NC_011991	CGC	2	6	122736	122741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2351	NC_011991	CGG	2	6	122748	122753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2352	NC_011991	ACC	2	6	122806	122811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109218
2353	NC_011991	GCC	2	6	122828	122833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109218
2354	NC_011991	CGG	2	6	122843	122848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109218
2355	NC_011991	GAA	2	6	122858	122863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222109218
2356	NC_011991	CAT	2	6	122924	122929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109218
2357	NC_011991	CTG	2	6	122978	122983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109218
2358	NC_011991	GACG	2	8	123026	123033	25 %	0 %	50 %	25 %	222109218
2359	NC_011991	CTG	2	6	123083	123088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109218
2360	NC_011991	GCC	2	6	123116	123121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109218
2361	NC_011991	GA	3	6	123163	123168	50 %	0 %	50 %	0 %	222109218
2362	NC_011991	CGT	2	6	123232	123237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109218
2363	NC_011991	CTG	2	6	123272	123277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109218
2364	NC_011991	GCA	2	6	123352	123357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109218
2365	NC_011991	TGG	2	6	123399	123404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222109218
2366	NC_011991	CTG	2	6	123410	123415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109218
2367	NC_011991	TTG	2	6	123471	123476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222109218
2368	NC_011991	GAC	2	6	123524	123529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109218
2369	NC_011991	GCA	2	6	123586	123591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109218
2370	NC_011991	TTGA	2	8	123605	123612	25 %	50 %	25 %	0 %	222109219
2371	NC_011991	GTG	2	6	123639	123644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222109219
2372	NC_011991	CGA	2	6	123692	123697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109219
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2374	NC_011991	GTGGCG	2	12	123778	123789	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	222109219
2375	NC_011991	ATG	2	6	123910	123915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109219
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2378	NC_011991	CCT	2	6	124247	124252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222109219
2379	NC_011991	CTT	2	6	124260	124265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109219
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2382	NC_011991	ATG	3	9	124375	124383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109219
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2386	NC_011991	TGC	2	6	124572	124577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109219
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2400	NC_011991	TCG	2	6	125410	125415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109219
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2405	NC_011991	TCA	2	6	125689	125694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2408	NC_011991	GC	3	6	125824	125829	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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2449	NC_011991	GAC	2	6	127742	127747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2451	NC_011991	A	8	8	127770	127777	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2452	NC_011991	ACA	3	9	127796	127804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2453	NC_011991	A	6	6	127806	127811	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2454	NC_011991	CGT	2	6	127816	127821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2455	NC_011991	TGC	2	6	127855	127860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2456	NC_011991	TTGA	2	8	127896	127903	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2457	NC_011991	TCT	2	6	127913	127918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2458	NC_011991	CT	3	6	127928	127933	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2459	NC_011991	CGA	2	6	128023	128028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2461	NC_011991	TAC	2	6	128068	128073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2462	NC_011991	TGCG	2	8	128126	128133	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2463	NC_011991	C	6	6	128251	128256	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2464	NC_011991	GGTG	2	8	128535	128542	0 %	25 %	75 %	0 %	222109223
2465	NC_011991	ACG	2	6	128543	128548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109223
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2470	NC_011991	AAGAG	2	10	128682	128691	60 %	0 %	40 %	0 %	222109223
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2472	NC_011991	CAG	2	6	128722	128727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109223
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2477	NC_011991	ATC	2	6	128921	128926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109223
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2479	NC_011991	TCGGC	2	10	129096	129105	0 %	20 %	40 %	40 %	222109223
2480	NC_011991	CTT	2	6	129222	129227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109224
2481	NC_011991	AACTG	2	10	129247	129256	40 %	20 %	20 %	20 %	222109224
2482	NC_011991	GAA	2	6	129293	129298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222109224
2483	NC_011991	ATGGA	2	10	129324	129333	40 %	20 %	40 %	0 %	222109224
2484	NC_011991	ATT	2	6	129392	129397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222109224
2485	NC_011991	TTC	2	6	129477	129482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109224
2486	NC_011991	TCA	2	6	129516	129521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109224
2487	NC_011991	CCG	2	6	129573	129578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109224
2488	NC_011991	TG	3	6	129711	129716	0 %	50 %	50 %	0 %	222109224
2489	NC_011991	CAG	2	6	129781	129786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109224
2490	NC_011991	CGTT	2	8	129816	129823	0 %	50 %	25 %	25 %	222109224
2491	NC_011991	CGG	2	6	129861	129866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109224
2492	NC_011991	CTCTC	2	10	129894	129903	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
2493	NC_011991	GAT	2	6	129927	129932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2494	NC_011991	A	6	6	130030	130035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2495	NC_011991	TTC	2	6	130084	130089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2496	NC_011991	GC	3	6	130094	130099	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2497	NC_011991	CGA	2	6	130103	130108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2498	NC_011991	CTC	2	6	130165	130170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2499	NC_011991	GC	5	10	130215	130224	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2500	NC_011991	AGA	2	6	130259	130264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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